Comino mide apenas 3,5 kilómetros cuadrados, sin embargo, su cuenca de aguas turquesas poco profundas atrae a más de medio millón de visitantes cada temporada.
La Blue Lagoon, una ensenada protegida flanqueada por acantilados de piedra caliza, debe su claridad eléctrica a las praderas de Posidonia que cubren el lecho marino y filtran el oleaje del Mediterráneo. La profundidad de la laguna rara vez supera los cuatro metros y la arena permanece blanca, blanqueada por la corriente constante. Los geólogos remontan su formación al levantamiento del Mioceno: la isla se asienta sobre una falla entre Malta y Gozo, y el mismo desplazamiento tectónico que esculpió los acantilados también excavó las cuevas marinas que bordean la costa norte de Comino.
Un tour privado en barco por la Blue Lagoon de Malta ofrece la única alternativa práctica al concurrido horario de los ferris. Los ferris comerciales salen de Cirkewwa y Mgarr cada 30 minutos en verano, dejando a los pasajeros en un único pontón público. Las lanchas rápidas privadas, por el contrario, pueden llegar a la laguna en menos de 20 minutos desde la bahía de Mellieha y anclar en calas tranquilas más allá de la zona de baño. La isla no tiene población permanente, solo una pequeña capilla, un quiosco estacional y la abandonada torre de Santa Marija, por lo que las cuevas y los acantilados permanecen libres de infraestructura. La mayoría de los chárteres privados realizan la ruta a través de la Crystal Lagoon, un canal más estrecho hacia el sur, y hacen una parada en las cuevas de Santa Marija, donde la piedra caliza ha sido erosionada formando cavernas a escala de catedral.
El gobierno maltés declaró a Comino reserva natural en 1988, prohibiendo la construcción y limitando los permisos de anclaje. La propia Blue Lagoon se encuentra dentro de una zona marina Natura 2000, y los capitanes deben poseer una boya de amarre autorizada para desembarcar pasajeros. El brillo turquesa, a menudo descrito como caribeño pero cinco grados más frío, alcanza su punto máximo por la mañana, cuando el sol incide sobre la cuenca desde el este. Al mediodía, la plataforma central de la laguna se convierte en una autopista de esnórquel; los tours privados en barco por la Blue Lagoon de Malta que salen antes de las 09:00 aseguran las aguas más claras y el amarre más fiable. El aislamiento de la isla la ha convertido en un lugar de rodaje: La isla de las cabezas cortadas, Troya y El conde de Montecristo rodaron secuencias a lo largo de los acantilados de Comino, utilizando las cuevas como escondites mediterráneos.
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